Program Studi Magister Ekonomi Islam UIN Prof. K.H. Saifuddin Zuhri Purwokerto berdiri sebagai respon atas perkembangan pesat ekonomi dan keuangan syariah di Indonesia, khususnya di wilayah Jawa Tengah bagian barat. Pendirian program studi ini dilatarbelakangi oleh kebutuhan akan sumber daya manusia yang memiliki kompetensi akademik dan profesional dalam mengembangkan ekonomi syariah di berbagai sektor.
Sejalan dengan transformasi IAIN Purwokerto menjadi UIN Prof. K.H. Saifuddin Zuhri Purwokerto, program magister ini resmi dibuka setelah memperoleh izin operasional dari Kementerian Pendidikan, Kebudayaan, Riset, dan Teknologi melalui Surat Keputusan … (nomor SK bisa ditambahkan sesuai dokumen resmi).
Sejak awal berdirinya, Program Studi Magister Ekonomi Islam mengusung semangat untuk mengintegrasikan nilai-nilai Islam dengan ilmu pengetahuan modern. Kurikulum dirancang berbasis riset dan kebutuhan industri, serta diperkuat dengan tenaga pengajar yang kompeten di bidang ekonomi, keuangan, dan bisnis syariah.
Dalam perjalanannya, program studi ini terus berkembang dan menjalin kerjasama dengan berbagai lembaga keuangan syariah, instansi pemerintah, serta organisasi masyarakat. Hal ini menjadi wujud komitmen UIN Saizu Purwokerto dalam mencetak lulusan yang profesional, berintegritas, dan berkontribusi nyata bagi pengembangan ekonomi Islam di tingkat regional, nasional, maupun global.